自行開車
南二高（國道三號）路線
南二高，至林邊交流道往東港方向直行，約10分鐘就可看到紅色拱橋（進德大橋），橋前左轉進朝隆路至碼頭（導航可搜尋東東琉線交通聯營處）。
中山高路線
中山高過中正交流道後，接88號東西快速道路（往屏東方向），下萬丹交流道，看到往東港的指示牌(往東港→右轉）順著路直走便可抵達東港。
搭乘高鐵
- 於高雄新左營站下車。
- 走出2號出口，轉搭墾丁公車往恆春方向經東港 → 東港輔英醫院下車後 → 向大鵬灣大飯店方向走約10分鐘就可抵達碼頭。
- 接搭計程車或事先預約共乘接駁車到東港碼頭。
搭乘臺鐵
- 於高雄火車站下車。
- 轉搭墾丁公車往恆春方向經東港 → 東港輔英醫院下車後 → 向大鵬灣大飯店方向走約10分鐘就可抵達碼頭。
- 接搭計程車或事先預約共乘接駁車到東港碼頭。
共乘接駁車
如果您有往返高雄、東港、高鐵站、火車站的接駁需求，可與業者做連繫。
共乘車聯絡電話：0912-443555 許先生
台灣大車隊：0986-082103 張先生
寄車資訊
阿西停車場（碼頭正對面）
聯絡電話：0920818843、(08)835-4243。
※ 告知住宿「杉灣小徑」。
※ 回程取車時，最好於回程上船時即通知業者你要取車，以節省等候時間。
船班資訊
東琉線交通船
電話：(08)832-5806
東港往小琉球
07:00 / 08:00 / 09:00 / 10:45 / 12:36 / 14:00 / 15:00 / 17:00
小琉球往東港
07:40 / 09:00 / 10:36 / 12:00 / 14:00 / 15:00 / 17:00 / 17:30
泰富輪船
電話：(08)833-5169
東港往小琉球
07:20 / 09:00 / 10:30 / 12:00 / 13:30 / 15:30 / 17:00
小琉球往東港
08:00 / 10:00 / 11:30 / 13:00 / 14:30 / 16:30 / 17:30
※ 船公司例假日採機動加班
藍白航運
電話：(08)833-4168、(08)833-4169
東港往小琉球
07:20 / 08:30 / 9:50 / 11:50 / 13:20 / 15:20 / 16:50
小琉球往東港
07:50 / 9:10 / 11:10 / 12:30 / 14:20 / 16:00 / 17:20
※船公司例假日採機動加班
船票取得
- 船票為來回票，僅能選擇一家拿取，不能混搭。
- 請至東港碼頭：東琉線聯營處、泰富輪船、藍白航運售票口。
- 告知住宿【杉灣小徑】您的姓名以及人數，售票人員核對無誤後就會拿船票給您（取票前請先收取入住人員身分證或健保卡以便船公司核對身分）。
- 開船時請撥打通知艾G機車（陳小姐）0936-145461搭乘船班名稱，以便至小琉球的碼頭接您，當您抵達小琉球碼頭，撥打電話聯絡艾G機車領取機車，艾G機車會帶領你們騎到民宿（無法開車接您們喔）。
- 建議搭乘10:00~12:30的船班。
- 參加生態導覽者可在訂房時，詢問當天活動時間，避免錯過導覽。
- 機車、腳踏車可隨人一起上船，於現場買票即可，收費標準：機車 NT$100／輛、腳踏車 NT$50／輛。